福建医科大学医学检验系成立于1984年，是全国第二批、福建省首家创办的全日制医学检验本科专业。1985年开始招生，拥有完整的本硕博一体化人才培养体系，1993年获批“临床检验诊断学”硕士学位授权点，2010年获批“临床医学”一级学科博士学位授权点；2017年获全国首批医学技术一级学科硕士学位授权点。专业办学积淀深厚，学科整体实力优厚，2008年获批福建省复合型医学检验人才培养模式创新实验区、2010年获批省级特色专业、2012年获批省级本科专业综合改革建设点、2017年获批省高等学校应用型学科、2020年获批国家级一流专业建设点、2023年获批省级高校虚拟教研室建设点，拥有省级医学检验技术实验教学示范中心、省级医学技术虚拟仿真实验教学中心、省级高校重点实验室等教学科研平台，在教育部第五轮学科评估中获评B+。

学系设有临床检验基础、临床生物化学、临床血液学、临床免疫学、临床微生物学、临床分子生物学、输血医学等7个教研室。拥有12家省级三甲医院、3家福建省医疗“创双高”建设单位和汉佰康、博奥2家医学检验企业作为实践教学基地。学系现有专兼职教师81人，其中教授12人，副教授30人，博士生导师8人，硕士生导师32人。拥有国家级中青年突出贡献专家1人，省级科技创新领军人才1人、省卫生健康突出贡献中青年专家1人、高层次人才3人、“百千万人才工程”1人、高校杰出青年科研人才4人、高校新世纪优秀人才7人、卫生健康中青年领军人才1人、中青年突出贡献人才1人。

近年来，学系教师承担国家级、省级科研项目45项，研究经费1500余万元，发表SCI收录论文113篇。获福建省科技进步一等奖2项、二等奖5项，福建省医学科技一等奖3项，福建省青年科技奖3项。学系积极开展教学改革，专业核心课程《临床血液学和血液检验》与《临床免疫学和免疫检验》获评国家级一流本科课程，《临床检验基础》、《医学实验室管理学》、《临床实验室管理学》、《临床微生物学与检验》、《临床分子生物学检验》等5门课程获评福建省一流本科课程。教师参编高等医药院校全国规划教材68部，其中主编9部，副主编17部；获福建省教学成果二等奖1项。此外，学系还获评福州市“五一先锋岗”与福建省“五一先锋号”荣誉称号。

办学40年以来，学系累计培养本科毕业生4000多人，硕士研究生300多人。毕业生就业面向各级医院、临检中心、血液中心、疾控中心、科研机构及医学院校，体外诊断生物试剂公司等，为福建省乃至全国医学检验行业高质量发展输送大批优秀人才。