1956年，创办阜阳高师速成班，设有语文、数学、物理、化学、地理等5科，学制为一年制。

1957年，学校更名为阜阳中学教师进修学校，设语文、数学、理化、史地等4科，学制为一年。

1958年9月，学校升格为阜阳专区师范专科学校，面向全省招生，学制两年，设中文科、数学科、理化科、史地科。

1963年10月，学校再次更名为阜阳中学教师进修学校，进行教师培训，设有理化科等。

1974年，学校为安徽师范大学阜阳分校，设理化系，开设物理专业和化学专业，学制为三年。

1977年底，开设“物理教育”专业（后为“物理学（师范）”专业），开启了本科生培养。1978年3月首批本科生入校。

1978年12月，教育部下文同意成立阜阳师范学院，为省属普通本科高校。1981年获批学士学位授权单位。

1980年，理化系分设为物理系和化学系。

2002年，开设“电子信息科学与技术”专业。

2007年11月，物理系更名为“物理与电子科学学院”。

2008年1月，学院整体搬迁至西湖校区。

2008年，开设“科学教育”专业。

2010年，开设“应用物理学”专业。

2012年，开设“电气工程及其自动化”专业。

2014年6月，学院更名为“物理与电子工程学院”。

2016年，开设“光电信息科学与工程”专业。

2017年，开设“通信工程”专业。

2017年12月，学院党组织由党总支调整设置为党委。

2019年，学校更名为阜阳师范大学。

2019年，开启研究生培养，电子与通信工程（2020年调整为电子信息）专业硕士点开始招生。

2020年，学科教学（物理）专业硕士点开始招生。

2021年，开设“机器人工程”专业。

2023年，电子信息学科获批安徽省高峰培育学科。

2023年，将“应用物理学”专业改造升级为“新能源材料与器件”专业。

2023年9月，“科学与技术教育”专业硕士点获批，学院决定2025年开始招生。