1923年4月，设立化学实验室，聂长庆任实验室主任。

1937年8月，设立理化系，赵雁来教授任系主任。

1944年，理化系改为化学系，王树勋任系主任。

1950年11月11日，化学系迎来新中国成立后招收的首批32名新生。

1954年11月20日，建筑面积3205.4平方米的化学馆完工验收。

1957年，化学系分出部分师生与贵州大学调来的有关教师，筹建起昆明工学院化工系。

1958年，中国共产党化学系总支部成立，高振中任总支书记。

1978年，戴树珊老师招收了二名攻读量子有机化学方向的研究生，开启了化学系研究生教学的新时代。

1981年4月，云南大学实验中心挂牌成立。

1981年11月，获有机化学、物理化学硕士授予权。

1985年，开始招收现代分析测试技术、应用化学等方向的专科生，1995年停止专科生招生。

20世纪90年代初，戴树珊教授被遴选为物理化学专业博士生导师，与吉林大学联合培养。

20世纪90年代初，依靠自己办学筹款和省教育工委的支持，又在校内建起面积8000平方米的新化学楼。

1993年11月，云南大学实验中心（更名为云南大学现代分析测试中心）通过国家计量认证实验室考核，为当时全国唯一一所获得国家计量认证资格的地方大学检测分析中心。

1995年，分析化学实验室率先获得云南省高等学校合格实验室称号。

1997年11月25日，学校决定以原生命科学和化学科学所属各单位为基础，组建云南大学生命科学与化学学院，洪品杰副校长兼任院长，张文逸任院党委书记。

2000年6月2日，药学院正式成立。

2002年2月，学校决定化学系、应用化学系、材料系、实验中心组建化学与材料工程学院，施南华任院长，张曙任院党委书记。

2002年，基础化学实验室通过评估，成为云南省首批省级示范实验室。

2003年7月，有机化学获准博士学位授予权，这是云南省化学学科的第一个博士点。

2003年7月，药学院获得药物化学硕士学位授权点。

2004年7月，制药工程专业开始招生。

2004年，获准无机化学硕士学位授权点。

2005年7月，食品科学与工程专业开始招生，2010年停止招生。

2005年12月15日化学学科独立建院，成立化学科学与工程学院，丁中涛任院长，杨云峰任院党委书记。

2006年4月，化学化工实验教学中心获准为校级实验教学中心。

2006年，化学一级学科成为省“十一五”建设的一类重点学科。

2007年5月，化学化工实验教学中心获准为省级实验教学示范中心，同年11月获准为国家级实验教学示范中心（建设单位）。

2007年9月14日，学院开始实行团队制建设。

2009年，基础化学实验教学队团成为国家级实验教学团队。

2009年，“特色资源利用化学教学科研团队”获中组部、中宣部、人保部、科技部4部门授予的“全国专业技术人才先进集体”称号。

2010年8月30日，洋浦校区实验室完成整体搬迁至呈贡新校区。

2010年7月，化学工程与工艺本科专业开始招生。

2010年，化学工程、制药工程硕士点开始招生，化学工程硕士点2015年停止招生。

2011年3月11日，获化学一级学科博士学位授权点。

2011年6月，学院党委被评为“云南省教育系统先进基层党组织”，陈景院士获得“云南省教育系统优秀共产党员”称号。

2011年，陈景院士团队的“阳宗海砷污染治理”项目工程顺利实施，治理取得决定性重大成果。

2012年11月26日，化学化工实验教学中心通过教育部组织的专家验收。

2013年9月，制药工程专业教学团队获准为省级教学团队。

2013年11月，制药工程专业获准为国家级卓越工程师计划试点专业。

2014年7月，化学化工虚拟仿真实验教学中心获省级虚拟仿真实验教学中心。

2014年7月，化学化工实验教学中心获云南省本科实践教学能力提升工程项目。

2014年8月，特色资源化学与化工创新人才培养基地获云南省2014年高水平大学创新人才培养基地建设项目。

2015年7月，高分子材料与工程本科专业开始招生。

2015年10月19日，化学科学与工程学院·药学院成立，曹秋娥任常务副院长，熊杰任院党委书记。