实验室根据国际相关学科发展趋势和国情需要，确立了学科方向和布局，鼓励和提倡多学科的交叉。实验室实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制，实行依托单位领导下的主任负责制。陕西省大分子科学重点实验室具有完善的管理制度，依据以下规章制度进行各项管理工作：《陕西省大分子科学化学重点实验室管理暂行条例》、《陕西省大分子科学化学重点实验室管理人员的分工与职责》、《陕西省大分子科学化学重点实验室学术委员会工作章程》、《陕西省大分子科学化学重点实验室学术活动暂行办法》、《陕西省大分子科学化学重点实验室安全卫生管理暂行规定》、《陕西省大分子科学化学重点实验室财务管理暂行办法》、《陕西省大分子科学化学重点实验室仪器管理与使用暂行规定》、《陕西省大分子科学化学重点实验室流动人员管理暂行办法》、《陕西省大分子科学化学重点实验室开放课题管理暂行办法》。实验室下设研究团队, 每个研究团队设1名课题组组长，其职责是管理课题组的日常运作。实验室设兼职秘书4名，负责处理实验室的日常行政事务和实验室档案资料的管理，做好协调组织等工作。实验室建立有自己的网站，用于实验室团队及研究领域的介绍和宣传。同时，网站定期更新室内最新研究成果。本实验室定期举办室内学术研讨会，积极深入地交流与讨论最新研究成果，实验室内不同背景的科研成员之间能够积极合作，开展前沿交叉方向研究，科研氛围浓厚，学术风气端正，无违反学术道德事件。

实验室学术委员会由国内外相关领域的知名同行专家组成。学术委员会委员的专业特长涵盖物理化学、理论计算化学、高分子化学、材料化学及应用化学等不同学科领域，以保证学术委员会能从相关领域的不同学术角度对实验室的研究方向和工作内容实施有效指导。学术委员会设主任1名，副主任1名，委员11名。学术委员会指导实验室确立并凝聚了学科布局和研究方向，协助审定了开放课题指南和审批了开放课题申请，评议了实验室的研究成果，通过讲学、短期工作等多种形式支持实验室的研究工作。