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农学院“岱下学宫-民之天论坛”学术报告
发布人:王敏  发布时间:2024-12-20   浏览次数:13

题目:基因组大数据辅助解析小麦条锈菌群体演化规律

主讲:贺飞 研究员

时间:12月23日(周一)15:00

地点:登高楼一楼学术报告厅

主讲人简介: 

贺飞,中科院遗传与发育生物学研究所研究员,中科院-英国约翰·英纳斯中心(JIC)植物和微生物联合研究中心(CEPAMS)课题组组长。本科毕业于西南大学农学与生命科学学院,2011年在中国农业大学生物学院获得生物信息学博士学位,先后在美国斯隆凯特琳癌症中心、布鲁克海文国家实验室、堪萨斯州立大学从事博士后研究。长期从事生物信息学与农作物基因组学研究。2021年建立课题组以来,致力于利用基因组学解析小麦抗病育种的进化机制。

报告简介:

随着高通量测序技术的普及,越来越多的小麦条锈菌基因组被测序。公共数据库中目前已经积累了数百份条锈菌的高通量测序数据。这些数据来自世界各地的实验室、针对不同的菌株、有着不同的实验设计与研究目的。我们对这些数据进行了整合,获得了一张高密度SNP的遗传多样性图谱。利用该图谱,我们不仅观察到了有性生殖的广泛痕迹,还观察到部分基因组区域存在重组被抑制的现象。结合比较基因组学分析,我们发现条锈菌基因组的杂合度并非是长期无性繁殖的结果,而是由于核单倍型之间差异造成。所以,公共数据的整合分析能够揭示小麦条锈菌的基因组演化规律。这些规律是否可以帮助定位无毒基因有待进一步探索。

                欢迎广大师生参加!

 

组织单位:农学院