- 本人治学严谨，学风端正。莫砺锋的博士论文《江西诗派研究》是其第一本学术著作，即以观点新颖、论证严密著称，在公开出版之前就受到学界关注，其附录之一《黄庭坚夺胎换骨辨》以单篇论文发表于《中国社会科学》1983年第5期，《百科知识》1985年第1期则详细介绍了其主要内容，《中国大百科全书》的编委会还特地邀请他撰写了《江西诗派》的词条。此书出版后曾获江苏省社科优秀成果二等奖，还被评为“改革开放以来南京大学文科有重要影响的学术著作”。莫砺锋的其它著作如《朱熹文学研究》、《唐宋诗歌论集》、《古典诗学的文化观照》等，都具有同样的特点。近年来，莫砺锋较多从事于旨在弘扬中华优秀传统文化的普及工作，无论是面对公众的演讲还是撰写普及类著作，他仍然坚持严谨、朴实的学风，决不哗众取宠。其普及类著作如《莫砺锋说唐诗》、《漫话东坡》等，都是言必有据，且尽可能融入个人学术研究的心得或学术界的创新成果。《莫砺锋说唐诗》因此而获得2009年“全国古籍整理优秀图书奖”（普及读物奖），又于不久前获得教育部“第六届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）”的“成果普及奖”。
- 在教学工作中注重学风教育，使南京大学古代文学学科严谨朴实的良好学风代代相传。无论是本科课程，还是研究生课程或论文指导，莫砺锋都强调学风端正的重要性，强调创新是学术研究的生命。例如莫砺锋曾连续多年为研究生开设《杜诗研究》课程，其课堂记录稿《杜甫诗歌讲演录》已由广西师范大学出版社列入“大学名师讲课实录”系列出版，多获学界好评。这门课程由他指导的研究生作业已有14篇以单篇学术论文的形式发表于《杜甫研究学刊》等学术刊物。
- 莫砺锋现任南京大学中国古代文学学科的学术带头人，他对本学科的学科建设多有贡献，其中较主要的贡献即在于学风建设。南大的中国古代文学学科，自从老一辈学术带头人程千帆、周勋初起便以学风朴实而著称，学科成员的学术研究都以札实的文献基础和强烈的问题意识为基本倾向。十多年前，莫砺锋接任本学科的学术带头人，他继承了老一辈的优良学风传统，带领学科成员坚守学术本位，努力抵御外界浮躁风气的不良影响。在他的带领下，本学科从不在课题申报或成果发表上追求数量，更没有发生过任何学术不端的现象。正因如此，本学科从上世纪八十年代以来，连续三次被教育部评为国家重点学科，且因成果卓著及学风朴实而成为在海内外享有盛誊的学术重镇。
莫砺锋非常关注整个学界的学风建设。早在2001年，他便撰写了《端正的学风是学术的生命》一文（刊登于《人民日报海外版》2001年9月25日），大声疾呼加强学风建设。他指出，学术乃天下公器，部分人的学术不端终将败坏整个中国学术界的声誉。他还指出，学术腐败已严重侵入出版机构、学术机构、学术评估体系的集体行为，长此以往，必将导致整个学术界风气的大溃坏。他认为解决学术腐败的有效办法之一是把一切学术评估类的活动都尽可能地公开化，使之具有相当的透明度。例如学术评奖，应把每个评委所设的票及其理由都予以公布，评出的结果也应在确定之前先公之于众并接受评议。为了借鉴海外的经验，莫砺锋还撰写了《台湾大学的学科评鉴》（《社会科学论坛》2006年第5期）一文，详细介绍了他应台湾大学校长邀请而赴台大参加该校中文系学科评鉴的经验和心得，为加强大陆的学风建设提供参照。莫砺锋应邀前往各兄弟院校讲学时，也经常涉及学风建设的内容。