江苏省软件工程研究中心于1999年7月经江苏省计划与经济委员会批准建设，依托南京大学“计算机科学与技术”国家一级重点学科、“软件工程”一级学科、计算机软件新技术国家重点实验室和江苏省软件新技术与产业化协同创新中心，支撑国家973计划项目、国家863计划项目、国家重大科技专项、江苏省科技支撑计划项目中的大规模软件系统研发，支撑南京大学镇江高新技术研究院承担项目中的大规模软件系统研发，在科学研究和成果转化之间建立承上启下的桥梁。
研究中心现有研究人员12人，其中教授5人，副教授4人，讲师3人，现任主任为陆桑璐教授。自建成以来，研究中心承担了国家973计划项目、国家863计划项目、国家自然科学基金项目、国家电网科技项目、江苏省科技支撑计划项目、江苏省自然科学基金项目、镇江市经信委资助项目、企业合作研发项目等多项科研项目。近五年来发表论文60余篇，包括国际期刊《IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems》、《IEEE Transactions on Computer》、《IEEE Transactions on Vehicular Technology》、《Computer Communications》等，国际会议ICNP、INFOCOM、MobiHoc、ICDCS、IPDPS、IWQoS、ICPP等。申请国家发明专利18项（获专利授权10项）、登记软件著作权10项。此外，以研究中心承接的企业合作项目为支撑，还与南京大学金陵学院、盐城师范学院开展了项目合作与人才培养工作。
江苏省软件工程研究中心以促进江苏省软件产业科技创新为目标，结合地方产业发展的需求，整合南京大学在计算机软件方面的学科与科研优势，加强软件系统工程化研发平台建设，形成高端软件工程技术研发基地。围绕计算机软件新技术，开展新型程序设计与软件方法学、分布计算与并行处理、软件质量保障与自动化技术、系统软件及信息安全，以及智能化与多媒体软件支撑技术等核心技术的研究和技术服务；并进一步依托这些技术成果，结合应用系统的共性特征和个性需求开展研究。特别针对软件测试平台、物联网应用、云计算平台、交互式视频服务、生物医学工程等应用开展研究及成果转化和技术辐射，并配合地区推动政产学研对接，联合/协助地区组织申报国家级、部省级科研项目，申请软件著作权及专利，积极推进成果转化，建立科研成果孵化基地，带动高端软件产业的技术提升和科技进步；为我省乃至全国软件产业和应用行业的快速发展提供一流的人才、技术，增强我省软件产业的技术创新能力和市场竞争能力，全面提升我省在全国软件行业的地位和影响力。