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人工智能超级计算精准药物发现:花椒素抗衰老,癌症免疫与新冠

2024年10月08日 10:03  点击:[]

报告时间:2024-10-11 14:00

报告地点:理化楼C401

报告人:魏冬青

主办单位:化学化工学院

报告人简介:

魏冬青,上海交通大学生命科学技术学院和微生物代谢国家重点实验室长聘教授(二级教授),鹏城实验室双聘教授,仲景中医药产业研究院院长,英国皇家化学院院士, 生物工程学会生物信息专委会副主委、国际交叉科学学会会长。荣获横山亮次奖,上海市科学进步一等奖等国内外奖项。在交叉学科多个领域做出了开拓性工作,特别是首次从理论上证明了铁电液晶的存在,首次揭示了爆炸反应的微观机理,发现并验证了花椒素的抗衰老作用。目前主要从事生物信息学研究,系统开展分子模拟,AI辅助药物设计以及基于人工智能的酶定向进化研究。在PRL、JACS、Gastroenterology和Nature子刊等期刊发表科学论文600多篇,主编专著14部,SCI引用16000多次, h10 330。

报告简介:

药物发现是识别具有潜在治疗作用的化合物的过程,其中,预测药物-靶标相互作用(DTI),药物-药物相互作用(DDI),药物组合(Drug Combinations)等是重要环节。我们开发了多个基于深度学习模型,大幅度提高了预测准确度。同时还开发了多肽设计、新生抗原设计,蛋白-蛋白相互作用调控剂设计等软件,为AI药物设计开拓了新途径。相关研究成果发表在Nature Machine Intelligence,Brief in Bioinformatics等期刊。将最新AI药物发现技术整合到计算机辅助药物设计软件,并进行超大规模的高性能计算、虚拟筛选,分子生成以及疫苗设计。以老年痴呆为靶标发现了花椒提取物WGX-50(花椒素)具有广泛的抗衰老作用,开展了大量的实验验证研究,证实花椒素作调控胆碱,β淀粉样蛋白等靶点可以作为老年痴呆治疗候选药物,通过抑制线粒体ROS和铁死亡减轻DOX诱导的心脏损伤,对皮肤具有抗衰老、保湿、美白和抗炎的功效。为AI药物发现提供了一个范例。发现了中药有效成分山奈酚具有抗新型冠状病毒作用,其IC50~34。筛选出了一个新冠病毒的有效多肽抑制剂——人肠防御素5。该多肽抑制剂通过掩蔽受体, 人血管紧张素转化酶2(ACE2)抑制新冠病毒(SARS-CoV-2)突刺蛋白对人黏膜细胞的侵袭,从而阻断新冠病毒传染途径,论文发表在 Gastroenterology(IF33)之上。

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