吉林大学档案馆是2000年合校后由原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院、中国人民解放军军需大学的档案馆（室）组建而成，是学校具有部分管理职能的直属单位，正处级建制。主要负责对全校综合档案的接收、保管、开发和利用。档案馆现下设3个展馆，分别是校史馆、黄大年纪念馆和历史名人纪念馆。

档案馆目前总建筑面积约8000平方米（其中3个展馆4500平方米、库房面积2500平方米）。档案馆内设8个科室，分别为综合科、档案管理科、档案利用科、档案立卷指导科、电子档案科、特色档案科、展馆管理科、校史编研科。

档案馆现保存学校各类档案共计10个全宗56万余卷，馆藏档案主要划分为党群、行政、教学、科研、产品、基建、设备、出版、外事、财会、声像、实物、人物等十三个门类。

档案馆在做好档案收集、管理、利用等常规工作基础上，近年来开展了一些有特色的工作。在档案治理体系建设方面，注重工作理念创新，加强顶层设计。提出依法治档、安全护档、高效用档、研究强档和开放活档“五位一体”工作理念；启动“吉林大学记忆工程”。在档案资源体系建设方面，开展抗击新冠疫情、脱贫攻坚、校庆活动等专题档案建设工作；加大声像、实物、人物等特色档案的多渠道收集力度，大大丰富了馆藏档案资源。在档案利用体系建设方面，深入开展校史研究工作，组织编撰校史系列丛书，举办系列专题展览，建成一批文化、教育展馆；与商管学院合作共建“吉林大学档案学专业实践教学基地”，有力发挥了档案馆在校园文化建设和档案人才培养方面的重要作用。在档案安全体系建设方面，引进RFID库房管理技术，提高了档案管理的智能化水平。

“见证历史、服务现在、着眼未来”，档案馆将按照“依法治档、安全护档、高效用档、研究强档、开放活档”的工作理念，扎实做好档案的收集、保管、开发与利用工作，不断推进我校档案工作迈向新的台阶，为学校推进“双一流”建设，为学校的各项事业发展做好基础服务。