1、生物炼制
木质纤维素生物质催化转化制备新能源、新材料和化学品，包括木质素、纤维素和半纤维素的分级分离，各组分的生物、化学和热化学催化转化研究，木质素的结构表征与生物合成；
2、酶工程
新型氧化还原酶的发现、功能和催化机制解析，酶分子改造和多酶催化级联体系的构建，固定化酶载体的合成及应用，生物催化在生物质转化、生物医药和重大污染物降解中的应用；
3、环境微生物学
森林生态系统中木材及森林凋落物的微生物分解机制，挖掘新型木材腐朽真菌菌株和基因资源，揭示木腐真菌降解转化木质纤维素的分子机制和生态功能。
