该项目由华东师范大学承担，项目负责人为侯立军研究员。项目以长江口作为典型研究区，运用稳定同位素示踪和现代分子生物学技术，系统研究河口近岸环境系统内厌氧氨氧化过程（ANAMMOX）的时空变异，分析ANAMMOX菌在河口近岸环境系统内的种群结构、丰度、多样性及其分布特征，定量剖析ANAMMOX菌的种群动态变化与ANAMMOX反应速率之间的耦合关系，揭示控制河口近岸环境系统内ANAMMOX过程的关键环境因子及其影响机制，并探讨ANAMMOX过程在河口近岸氮素生物地球化学循环中的重要性，以期为长江口和我国其它河口近岸生态环境的保护与管理、以及流域氮污染控制提供重要的理论支撑。