从事病原菌及其耐药性产生机理、传播途径、防控措施和病原菌与宿主互作机制研究，主要研究内容包括重要病原菌流行病学调查、流行特征分析、基因组生物信息学分析、耐药表型与耐药基因型研究、新耐药基因发现、耐药基因传播机制研究、抗生素替代品研发与饲料添加方案研究等。

1. Ju Gu, Yun-xia Li, Chang-wen Xu, Xian-jun Xie, Ping Li, Guang-xu Ma, Chang-wei Lei, Jin-xin Liu, An-yun Zhang*, “Genome sequence of multidrug-resistant Erysipelothrix rhusiopathiae ZJ carrying several acquired antimicrobial resistance genes”, J Glob Antimicrob Resist. 2020, 21, 13–15. (IF: 4.349)
2. Chang-wen Xu, An-Yun Zhang, Chun-Mei Yang, Yun Pan, Zhong-Bin Guan, Chang-Wei Lei, Lin-Yao Peng, Qing-Zhou Li, and Hong-Ning Wang*. “First report of the macrolide resistance gene erm(T) harbored in a novel small plasmid from Erysipelothrix rhusiopathiae”. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2015，59: 462-5. (IF: 5.938)
3. Zhang A, Li Y, Guan Z, Tuo H, Liu D, Yang Y, Xu C.W, Lei C, Wang H*.“Characterization of Resistance Patterns and Detection of Apramycin Resistance Genes in Escherichia coli Isolated from Chicken Feces and Houseflies after Apramycin Administration”. Front Microbiol. 2018. 9:328. (IF: 6.064)

纵向课题：
1.主持四川省科技应用基础项目：《动物源和人源革兰氏阳性病原菌对恶唑烷酮类药物耐药机制研究》，2021YJ0271， 2021－2023。
2.主持四川省公益性科研院所基本科研业务费项目：《动物源革兰氏阳性病原菌对恶唑烷酮类药物耐药机制研究》，2020JDKY0032，2020－2022。
3. 主持四川省科技厅应用基础项目:《兔源金黄色葡萄球菌多重耐药基因机制及传播机制研究》，2017YJ0290，2017-2019。
4.主持四川省公益性科研院所基本科研业务费项目：《家兔源金黄色葡萄球菌中酰胺醇类与大环内酯类药物共耐药机制研究》，2017－2018。
奖励：
1.2018年获四川省科技进步奖一等奖1项；
2.2022年获全国农牧渔业丰收成果奖二等奖1项。